科学网深圳湾实验室肿瘤研究所【张雷课题组】

2021-01-16 19:44

深圳湾实验室简介 

深圳湾实验室(生命信息与生物医药广东省实验室)由深圳市科创委和北京大学深圳研究生院共同举办,协同深圳市以及中国香港和中国澳门相关领域具有研究基础和应用优势的单位合作共建,目标培育创建国家实验室、打造国家实验室“预备队”。肿瘤研究所是深圳湾实验室直属研究机构。  

课题组简介 

课题组组长:张雷,深圳湾实验室研究员,北京大学-清华大学生命科学联合中心(CLS)/北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)博士后,博士毕业于北京大学分子医学研究所,2016年加入CLS/BIOPIC, 合作导师为张泽民教授,从事结直肠癌肿瘤微环境单细胞功能与组学技术应用研究。曾获北京大学-清华大学生命科学中心杰出博士后基金、北京大学杰出博士后,Bayer-北京大学转化研究中心优秀博士后等荣誉。 

近期工作包括在单细胞层面系统性地解析结直肠癌浸润T淋巴细胞和髓系细胞的特征及动态关系;与团队共同开发STARTRAC生物信息学追踪方法,解析不同结直肠癌病人的T细胞亚型差异;揭示不同靶向髓系免疫治疗策略的潜在作用机理。研究成果以第一共同作者发表在Nature(2018)、Cell(“Best of 2020”)等杂志上,并受邀在Cancer Immunology Research(2019)等杂志对领域进行综述和展望。 

课题组致力于整合患者和小鼠模型的单细胞多组学分析及体内外功能研究,以1)从分子和细胞层面解析肿瘤以及免疫相关疾病的发病机理,2)探究免疫疗法的响应及抵抗机制,3)探索肿瘤发生/治疗响应相关细胞的功能及下一代靶向策略。因课题组科研工作需要,诚邀优秀的有志青年加入课题组共谋发展。 

近期工作参考 

1. Zhang L*, Li Z*, Skrzypczynska M.K.*, Fang Q, Zhang W, O’Brien S. A., et al. Single-cell analyses inform mechanisms of myeloid-targeted therapies in colon cancer. Cell, 2020, 181:442-459. 

2. Zhang L and Zhang Z, Re-characterizing tumor-infiltrating lymphocytes by single-cell RNA sequencing. Cancer Immunology Research, 2019, 7(7):1040-1046. 

3. Zhang L*, Yu X*, Zheng L*, Zhang Y* Li Y, Fang Q, et al. Lineage tracking reveals dynamic relationships of T cells in colorectal cancer. Nature, 2018, 564(7735):268-272. 

4. Yu X, Zhang L, Chaudhry A, Rapaport A, Ouyang W, Unravelling the heterogeneity and dynamic relationships of tumor-infiltrating T cells by single-cell analysis, Journal of Leukocyte Biology, 2020, 1-16 

5. Ren X*, Zhong G*, Zhang Q, Zhang L, Sun Y, Zhang Z, Reconstruction of cell spatial organization based on ligand-receptor mediated self-assembly. Cell Research, 30, 763–778(2020). 

6. Liu F*, Zhang Y*, Zhang L, Li Z, Fang Q, Gao R, Zhang Z. Systematic comparative analysis of single-nucleotide variants detection methods from single-cell RNA sequencing data. Genome Biology, 2019, 20(1):242. 

7. Zhang Y, Zheng L, Zhang L, Hu X, Ren X, Zhang Z. Deep single-cell RNA sequencing data of individual T cells from treatment-naïve colorectal cancer patients. Scientific Data, 2019, 6(1):131. 

8. Yang R*, Cheng S*, Luo N*, Gao R, Yu K, Kang B, Wang L, Zhang Q, Fang Q, Zhang L, et al. Distinct epigenetic features of tumor-reactive CD8+ T cells in colorectal cancer patients revealed by geneome-wide DNA methylation analysis. Genome Biology, 2019, 21(1):2. 

9. Guo X*, Zhang Y*, Zheng L*, Zheng C*, Song J, Zhang Q, Kang B, Liu Z, Jin L, Xing R, Gao R, Zhang L, et al. Global characterization of T cells in non-small-cell lung cancer by single-cell sequencing. Nature Medicine, 2018, 24(7):978-985. 

副研、助理研究员(1-2名) 

(一)岗位职责: 

1. 协助指导实验室博士后和研究助理的科研工作; 

2. 独立或协助申请各级科研项目; 

3. 协调与其他科研和临床机构的合作,协助实验室负责人从事实验室的各类管理工作。  

(二)应聘条件: 

1. 生物学、基础医学、计算机、统计学、生物信息学或相关专业方向,包括但不限于肿瘤生物学、免疫学、细胞生物学的实验经验或计算统计分析经验;具有强烈的探索生命科学问题兴趣;具备独立工作能力; 

2. 具有国内外一流研究机构博士学位或博士后研究经历; 

3. 以第一作者或通讯作者发表过高水平科研论文; 

4. 能熟练以英文作为工作语言进行学术交流; 

5. 责任心强,具备杰出的学术道德和职业操守、良好的沟通能力和团队合作精神。 

(三)福利待遇: 

1. 基本待遇包括国家规定的相关福利、五险一金以及户口和子女入园/学等参照深圳湾实验室相关规定执行。提供国内(包括深圳)生物医学领域极具竞争性的待遇条件,具体薪酬根据应聘者资历和成果面议; 

2. 协助申请深圳或者国家层面人才引进的相关计划,提供国际水准的研究条件,学术氛围浓厚,气氛融洽; 

3. 海外博士/博士后留深工作的,如满足深圳市高层次人才标准要求,可申请孔雀人才补助(B 类 200万;C类160万元)。 

博士后(3名) 

(一)岗位职责: 

1. 在课题组组长指导下开展科研工作,同时欢迎优秀博士/后自带课题加入课题组开展合作; 

2. 协助申请国家自然科学基金及省、市各级项目或作为负责人申请博士后科学基金。 

(二)应聘条件: 

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